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集结经典应用案例
用户成功案例解读
分享项目中的最佳实践方案
材料科学 药物发现 药品申报 药物开发 生物信息 AI计算模拟成功用户 数字赋能最佳实践
Discovery Studio案例二：不做实验也能发文章第二弹，基于Discovery Studio分子模拟发现具有CypD抑制潜力的小分子化合物
Discovery Studio案例二：不做实验也能发文章第二弹，基于Discovery Studio分子模拟发现具有CypD抑制潜力的小分子化合物
本文利用已知CypD抑制剂进行3D-QSAR药效团模型构建与虚拟筛选、分子对接和分子动力学模拟发现具有CypD抑制潜力的小分子化合物。
Discovery Studio案例一：不做实验也能发高分文章，利用Discovery Studio计算模拟发现新型c-Met抑制剂
Discovery Studio案例一：不做实验也能发高分文章，利用Discovery Studio计算模拟发现新型c-Met抑制剂
本研究利用分子模拟软件Discovery Studio（简称DS）进行多种计算模拟方法的联合使用，用于发现全新的c-Met抑制剂。
SYNTHIA™案例一：经实验验证的AI赋能小分子化合物逆合成路线设计软件
SYNTHIA™案例一：经实验验证的AI赋能小分子化合物逆合成路线设计软件
AI赋能小分子化合物逆合成路线设计软件SYNTHIA，历经19+年，基于有机化学专家和计算机科学家共同手动编码100,000+反应规则，能够设计出合理的化合物合成路线。
OpenEye应用案例四十五：基于配体结构虚拟筛选发现结构新颖的Kras-G12D抑制剂
OpenEye应用案例四十五：基于配体结构虚拟筛选发现结构新颖的Kras-G12D抑制剂
根据已报到Kras-G12D抑制剂MRTX1133[1]的3D结构，使用Openeye[2]对含有60979个小分子化合物的数据库[3]进行基于结构相似性程序Rocs筛选，优选前500个化合物；再进行基于静电相似性程序EON筛选，优选前100个化合物。通过与MRTX1133的叠合选择其中12个化合物，进一步进行结构改造以匹配关键药效团；再使用Openeye中分子对接程序HYBRID进行结合模式验证，得到12个针对Kras-G12的先导化合物，对其中2个分子的对接结果进行基于SBDD和FBDD的分子设计，通过Openeye中分子对接程序POSIT进行结合模式验证，最终设计产生2个具有潜在活性而且结构新颖的Kras-G12D抑制剂。
OpenEye应用案例四十四：虚拟筛选发现促肾上腺皮质激素释放因子1受体抑制剂的研究
OpenEye应用案例四十四：虚拟筛选发现促肾上腺皮质激素释放因子1受体抑制剂的研究
CRF主要通过CRF1受体参与调节下丘脑-垂体-肾上腺轴应激反应。CRF分泌或合成异常都会造成病理学上一系列神经疾病，如焦虑、沮丧、行为异常、帕金森病、强迫症、惊恐障碍等。因此，CRF1受体成为治疗神经精神疾病药物的潜在靶标。
OpenEye应用案例四十三：细胞色素c过氧化酶抑制剂的发现研究
OpenEye应用案例四十三：细胞色素c过氧化酶抑制剂的发现研究
本研究靶向CcO进行新型抑制剂的发现，以期得到抑制细胞色素c氧化酶活性的新型化合物，从而调控生物体的代谢过程。
OpenEye应用案例四十二：虚拟筛选发现新型HIV-1抑制剂的研究
OpenEye应用案例四十二：虚拟筛选发现新型HIV-1抑制剂的研究
近年来随着HIV-1整合酶N端区域、核心区域和C端区域的相继测定和推断，HIV整合酶及其抑制剂的研究逐渐成为抗HIV药物发展的一个热点。
OpenEye应用案例四十一：新型减肥药物的发现
OpenEye应用案例四十一：新型减肥药物的发现
本研究选择基于配体药物设计方法进行虚拟筛选，发现了一些有效治疗肥胖的新型化合物结构。
OpenEye应用案例四十：多巴胺类似物的发现研究
OpenEye应用案例四十：多巴胺类似物的发现研究
一般情况下患者体内的多巴胺数目少于正常量的50%时，帕金森的症状就会出现了。因此发现多巴胺类似物，来治疗和缓解帕金森病症就变成了一个重要的研究方向。
OpenEye应用案例三十九：阿片受体抑制剂发现的研究
OpenEye应用案例三十九：阿片受体抑制剂发现的研究
阿片受体自发现以来，一直是生命科学的研究热点之一。阿片类药物的镇痛、耐受机理的阐明以及新的更理想阿片类药物的研究仍是比较重要的方向。
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