Posit
现代化、高效且合规的统计编程平台
Posit (前身为 RStudio) 提供的三大核心产品—Posit Workbench、Posit Connect 和 Posit Package Manager——构成了一套强大的、企业级的解决方案,旨在系统性地解 决这些痛点,为制药和生物技术公司提供现代化、高效且合规的统计编程平台。
平台核心组件详解
Posit Workbench (原RStudio Workbench)
定位:
企业级的集中式开发环境。
部署方式:
本地部署 (On-Premises): 安装在公司内部的数据中心 或私有云服务器上,满足对数据驻留和安全有严格要求的 公司。IT 部门负责服务器的配置、维护和用户权限管理。
云端部署(Cloud): 部署在AWS、Azure 或 GCP 等主流 云平台上。Posit 提供官方的云市场镜像,可以快速启动。 云部署提供了更好的弹性伸缩能力和更低的初始运维成本。
混合部署(Hybrid): 结合本地和云端的优势,例如将 Workbench 部署在云端,但数据存储在本地或通过安全 连接访问。
关键配置:无论哪种部署,都需要配置用户认证(如 LDAP, Active Directory,SAML)、项目共享空间、计算资源配置 (CPU, 内存)、会话超时策略以及与 Package Manager的 集成。
Posit Connect
定位:
企业级的内容发布、调度和协作平台。
部署方式:
独立服务器部署:通常部署在与Workbench 相同或不 同的服务器上,作为内容的中央枢纽。需要配置Web 服务 器、数据库后端以及与Workbench的连接。
高可用部署 (High Availability):为确保关键报告和仪 表板的持续可用性,可配置多节点集群,实现负载均衡和 故障转移。
权限与访问控制:精细化的用户和组权限管理,确保只有 授权人员可以查看、编辑或调度特定内容。支持 SSo(Single Sign-On)集成。
内容类型:主要用于发布和管理由统计程序员在 Work-
bench中创建的 Shiny应用、R Markdown/Quarto 报 告 、Plumber API、Jupyter Notebooks等。
Posit Package Manager(PPM)
定位:
企业级的 R、Python 及其他语言包的中央仓库和生命周期管理工具。
部署方式:
本地仓库服务器:部署在公司内部网络,作为所有开发环境(Workbench) 和生产环境(Connect) 的唯一官方包源。这是生命科学 领域最推荐的部署方式,因为它能完全控制包的版本和来源,满足严格的合规审计要求。
上游源配置:PPM 可以配置为从 CRAN、PyPI、Bioconductor 等公共源同步包,也可以托管公司内部开发的私有包。
版本冻结(Snapshot): 核心功能。PPM 可以为特定项目或整个组织在特定时间点创建一个“快照”,锁定所有依赖包的精确版本。 这确保了分析在任何时间、任何地点都能被完美重现。
解决的统计编程业务痛点
这套平台组合直接针对临床开发统计编程中的核心痛点:
环境不一致导致结果不可重现
解决方案:PPM 通过创建和分发版本快照,确保所有程序 员、QA 人员和生产服务器使用完全相同的软件包版本。Workbench的项目环境可以绑定到特定的PPM 快照,从 根源上杜绝了“在我机器上是好的”问题。
协作效率低下,知识传递困难
解决方案:Workbench 提供集中的项目空间,支持实时协作、 代码审查和版本控制(集成Git)。Connect作为中央内容门户, 让统计程序员、统计师、医学写作人员和管理层都能轻松访问最 新的动态报告和仪表板,无需繁琐的邮件发送或文件共享。
手动报告分发与版本管理混乱
解决方案:Connect自动化了报告的发布、版本控制和访 问权限管理。程序员只需“发布”一次,所有授权用户即可 看到最新版本。历史版本被自动存档,便于审计和回溯。
计算资源受限,大型分析耗时过长
解决方案:Workbench 支持将计算任务提交到高性能计算 (HPC) 集群或云端实例。程序员可以在本地轻量级环境中编写代码,然后将繁重的计算任务(如 Bootstrap、模拟)发 送到后台服务器,大幅缩短分析周期。
缺乏标准化和最佳实践
解决方案:平台强制推行标准化的开发、测试和部署流程。 PPM 确保包管理的标准化,Workbench 的模板和项目结 构促进代码规范,Connect 的发布流程确保交付物的标准化。
合规与审计挑战
解决方案:整个平台提供详尽的审计日志,记录谁在何时 做了什么(代码修改、包安装、报告发布)。PPM 的快照功能 为每次分析提供了完整的、可验证的软件环境清单,这是满 足21 CFR Part 11和 ALCOA+ 原则的关键。
软件平台的核心优势
提升可重现性与合规性 通过 PPM 的版本快照和平台 的审计日志,为监管提交提供 坚实的技术保障。 | 加速开发与交付周期 自动化的工作流、强大的计算 能力和高效的协作工具,显著 缩短从数据到洞察的时间。 | 增强团队协作与沟通 打破信息孤岛,让跨职能团队 在统一的平台上无缝协作。 |
降低IT 运维复杂度 集中式管理简化了软件部署、 更新和安全补丁的推送。 | 提高资源利用率 通过集中管理和调度,优化计 算资源的使用。 | 促进创新 程序员可以将更多精力从环境配 置和手动操作中解放出来,专注于 更复杂的统计方法和创新性分析。 |
行业应用与知名客户
Posit 平台在生命科学领域拥有广泛的客户基础,许多制药公司和 CRO (合同研究组织)都在其临床开发流程中部署了该平台。
知名制药公司(部分公开或行业共识):
辉瑞(Pfizer)
诺华(Novartis)
罗 氏(Roche)/ 基因泰克(Genentech)
赛诺菲(Sanofi)
阿斯利康(AstraZeneca)
礼来(Eli Lilly and Company)
强 生(Johnson &Johnson)
百时美施贵宝(Bristol Myers Squibb,BMS)
默克(Merck &Co., 在美国和加拿大外称为 MSD)
知名CROs:
IQVIA
ICON plc Parexel
Syneos Health
Posit Workbench、Connect 和 Package Manager不仅仅是一套工具,它们共同构建了一个现代化、企业级的统计编程生态系统。对于身处高度监管、追求效率与创新的生命科学领域而言,这套平台是解决传统工作流痛点、提升团队生产力、确保分析合规可 重现、并最终加速新药上市进程的战略性投资。随着越来越多的行业领导者采用并成功实践,Posit 平台已成为临床开发统计编程领域的事实标准之一。
原厂链接:https://posit.co/