集结经典应用案例<br/>用户成功案例解读<br/>分享项目中的最佳实践方案
A classic case
集结经典应用案例
用户成功案例解读
分享项目中的最佳实践方案
材料科学 药物发现 药品申报 药物开发 生物信息 AI计算模拟成功用户 数字赋能最佳实践
OmicSoft 案例一：使用OmicSoft OncoLand进行药物靶点和生物标志物研究
OmicSoft 案例一：使用OmicSoft OncoLand进行药物靶点和生物标志物研究
GEO、TCGA和其他公共肿瘤学数据资源是生物学家、生物信息学家等进行数据挖掘的宝库，使用OmicSoft OncoLand人工整理收录的数据集资源可以加速生物标志物发现的过程、提高可靠性。
IPA案例二十一——药物研发新思路：通路分析与靶标确认
IPA案例二十一——药物研发新思路：通路分析与靶标确认
CLC案例十二——病原微生物NGS生信分析案例解读
CLC案例十二——病原微生物NGS生信分析案例解读
经过样本处理、核酸提取、文库制备、上机测序等一系列操作后，我们会得到病原微生物NGS数据，而这才是新挑战的开始。生物信息学分析和结果解读的准确完成，才意味着这些NGS数据发挥了它们的价值。想要实现这些，需要完备的分析平台和较高专业素质的研究人员。本文将以一篇文献为例，了解如何使用CLC平台进行微生物数据的分析。
CLC案例十一——CLC工作流助力“病毒杂交捕获数据分析”和“病毒整合位点识别”
CLC案例十一——CLC工作流助力“病毒杂交捕获数据分析”和“病毒整合位点识别”
一文拿下病毒整合位点分析（附CLC分析流程）
IPA案例二十——使用IPA和OmicSoft进行药物治疗、毒理学和靶点安全性评估
IPA案例二十——使用IPA和OmicSoft进行药物治疗、毒理学和靶点安全性评估
“安全性问题”一直是新药研发中重点关注的问题，也是影响创新医药产业发展的重要因素。随着我国创新药物研究政策与法规的改革，药品研发模式与方向发生了变化，安全性评价研究领域的热点逐步拓展至新型抗体药物、干细胞产品、CAR-T细胞产品、抗体药物偶联物（ADC）药物、溶瘤病毒药物和基因治疗药物等方面。
IPA案例十九——中药也有作用靶点和分子机制
IPA案例十九——中药也有作用靶点和分子机制
中药作用靶点和分子机制的研究极为重要，借助通路分析工具IPA，将有助于推动中药的现代化研究。
IPA案例十八——IPA揭示单细胞视角下小鼠食管上皮细胞群的通路调节
IPA案例十八——IPA揭示单细胞视角下小鼠食管上皮细胞群的通路调节
单细胞技术让科学家们获得更深维度的数据，而IPA可以从生物学角度对这些复杂的数据进行诠释。
IPA案例十七——IPA在中药领域应用二例
IPA案例十七——IPA在中药领域应用二例
中药成分复杂，有效的成分和生物靶点之间存在及其复杂的网络关系。本案例列举两篇利用网络生物学模型来分析中药成分-靶点-机制的文献，为中药研究提供药效机制的新思路。
IPA案例十六——采用IPA用网络发掘的方法重新探索Clomiphene对埃博拉感染的治疗作用
IPA案例十六——采用IPA用网络发掘的方法重新探索Clomiphene对埃博拉感染的治疗作用
埃博拉病毒的最致命的病原体之一，其发病和宿主免疫应答机制尚不清楚，找到有效治疗方法至关重要。针对小鼠肾脏和肝细胞模型的化合物筛选表明，FDA批准的雌激素受体激动剂/拮抗剂克罗米芬Clomiphene能够显著控制埃博拉感染并提高小鼠的存活率。
IPA案例十五——QIAGEN为循环转录组学提供进阶RNA-Seq挖掘整体解决方案
IPA案例十五——QIAGEN为循环转录组学提供进阶RNA-Seq挖掘整体解决方案
本文针对摄取胰腺癌外泌体后的Kupffer细胞的转录组进行分析，揭示了通过外泌体的癌症转移过程中涉及的途径和生物学过程。主要采用了CLCbio的Bx进行了原始的测序数据的整理并使用IPA进行了深度数据挖掘。
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