Discovery Studio生命科学综合建模与模拟平台的主要功能
生物大分子建模与优化
构建和修饰多肽和蛋白;查询在线数据库;蛋白结构处理;蛋白序列相似性搜索;蛋白序列和结构的叠合;蛋白/核酸的序列分析;蛋白进化分析;蛋白质三维结构的预测与评价、搜索蛋白侧链构象;蛋白三维结构优化;抗体序列性质分析;抗体结构预测;抗体人源化预测;大分子对接与相互作用分析;抗体亲和力成熟;抗体的设计与分析;酶的设计与优化;虚拟氨基酸突变;二硫键预测;蛋白制剂性质计算;蛋白聚集效应预测。
基于靶标结构药物设计
分子对接,包括高通量虚拟筛选程序Libdock,精准对接程序CDOCKER,全柔性对接程序Flexible Docking;类似物3D结合构象生成;全新药物设计、me too/me better 药物设计、基于片段的从头药物设计等。
基于配体药物设计部分
骨架跃迁;片段生长;基于配体的药效团设计;基于配体-受体复合物的药效团设计;化合物数据库的构建和筛选;药效团数据库的构建与保存;基于药效团数据库的反向找靶;定量构效关系(QSAR/QSPR)构建与分析;虚拟组合化学库的设计与分析;小分子类药性筛选;化合物构象搜索和分析化合物 ADMET 和毒性预测等。
药效团模型
基于上述模拟功能,Discovery Studio的应用主要涵盖药物、化学、生物三大学科,研究领域包括:疾病的发病机理研究、新药发现和设计、生物信息学、结构生物学、酶学、免疫学、病毒学、蛋白质工程、肿瘤研究、食品科学、环境毒理研究等。