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AI-enriched COMPUTATIONAL SIMULATION
AI计算模拟
以AI、大数据分析及数字化工作流为基础的综合计算模拟解决方案
2022年IPA春季更新
2022年IPA的第一个最新版本与大家见面啦！此版本改进了易用性并增强了搜索功能，而且，IPA知识库数据量已超过980万条，数据集收录超过11万个。
2022年IPA春季更新
2022年IPA的第一个最新版本与大家见面啦！此版本改进了易用性并增强了搜索功能，而且，IPA知识库数据量已超过980万条，数据集收录超过11万个。
功能更新
在新版IPA中，搜索工具更易于使用了。所有搜索选项都已整合到主工具栏中，包括Genes and Chemicals，Diseases and Functions，Pathways and Lists，Datasets and Analyses共四大类搜索方式，如下图。
此外，用户还可以在标准通路和毒物列表中找到感兴趣的基因、化学物质、疾病和生物功能等，以此加速研究。也可以按名称或其中的基因或化学物质等搜索自己的自定义通路和列表，也可以在添加到通路的注释中搜索。
例如，您可以搜索一个基因名，比如“FASLG”，并找到该基因参与的所有通路和列表（下图）。结果返回了57个经典通路和Tox列表，FASLG在其中是参与者。在以前的IPA版本中，这种查询不会返回结果，因为以前的搜索工具只搜索通路名称和类别，而不搜索通路或列表中包含的基因、化合物等。
同样，对功能性疾病术语的搜索，如果该术语位于通路上的节点或通路名称中，搜索结果可返回经典通路或Tox列表（如下图）。
对于经典通路，搜索会自动“扩展”到组和复合物，以便在其中查找基因和蛋白质名称。例如，搜索RAF、ARAF、BRAF或RAF1会返回一个包含组“RAF”的经典通路。但是，请注意，当您打开通路时，不会立即看到ARAF、BRAF或RAF1节点，因为它们是RAF组的成员，所以会在图中显示为单个节点。您可以使用“My Pathways”工具栏的“Graph Options”按钮中的“Expand Members/Membership”选项，或右键单击这个组的节点打开“Expand Members/Membership”选项，手动扩展RAF节点来查看这些具体的分子。
功能更新
在新版IPA中，搜索工具更易于使用了。所有搜索选项都已整合到主工具栏中，包括Genes and Chemicals，Diseases and Functions，Pathways and Lists，Datasets and Analyses共四大类搜索方式，如下图。
此外，用户还可以在标准通路和毒物列表中找到感兴趣的基因、化学物质、疾病和生物功能等，以此加速研究。也可以按名称或其中的基因或化学物质等搜索自己的自定义通路和列表，也可以在添加到通路的注释中搜索。
例如，您可以搜索一个基因名，比如“FASLG”，并找到该基因参与的所有通路和列表（下图）。结果返回了57个经典通路和Tox列表，FASLG在其中是参与者。在以前的IPA版本中，这种查询不会返回结果，因为以前的搜索工具只搜索通路名称和类别，而不搜索通路或列表中包含的基因、化合物等。
同样，对功能性疾病术语的搜索，如果该术语位于通路上的节点或通路名称中，搜索结果可返回经典通路或Tox列表（如下图）。
对于经典通路，搜索会自动“扩展”到组和复合物，以便在其中查找基因和蛋白质名称。例如，搜索RAF、ARAF、BRAF或RAF1会返回一个包含组“RAF”的经典通路。但是，请注意，当您打开通路时，不会立即看到ARAF、BRAF或RAF1节点，因为它们是RAF组的成员，所以会在图中显示为单个节点。您可以使用“My Pathways”工具栏的“Graph Options”按钮中的“Expand Members/Membership”选项，或右键单击这个组的节点打开“Expand Members/Membership”选项，手动扩展RAF节点来查看这些具体的分子。
内容更新
本季度新增了超过127.5万项新发现，使得IPA知识库数据量超过980万条。内容包括BioGrid的蛋白-蛋白相互作用、COSMIC的基因-癌症类型发现、ClinicalTrials.gov的靶点-疾病发现、药物-疾病发现、OMIM的基因-疾病关系、CCRIS的化学物质-癌症发现、ClinVar的癌症-突变发现、THPA的RNA表达-细胞类型发现等知识内容。
另外，在主界面的右上角，用户可以直接连接到Land Explorer，探索超过11万个数据集（具体数据统计如下表）。当然，这些数据集除了可以在Land Explorer中进行分析外，还可以在Analysis Match、Activity Plot、Pattern Search中进行分析。
IPA软件每季度都会进行定期的功能更新，每周进行数据的更新。欢迎体验新版本！
内容更新
本季度新增了超过127.5万项新发现，使得IPA知识库数据量超过980万条。内容包括BioGrid的蛋白-蛋白相互作用、COSMIC的基因-癌症类型发现、ClinicalTrials.gov的靶点-疾病发现、药物-疾病发现、OMIM的基因-疾病关系、CCRIS的化学物质-癌症发现、ClinVar的癌症-突变发现、THPA的RNA表达-细胞类型发现等知识内容。
另外，在主界面的右上角，用户可以直接连接到Land Explorer，探索超过11万个数据集（具体数据统计如下表）。当然，这些数据集除了可以在Land Explorer中进行分析外，还可以在Analysis Match、Activity Plot、Pattern Search中进行分析。
IPA软件每季度都会进行定期的功能更新，每周进行数据的更新。欢迎体验新版本！
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