AI计算模拟
AI-enriched COMPUTATIONAL SIMULATION
AI计算模拟
以AI、大数据分析及数字化工作流为基础的综合计算模拟解决方案

抗体药物设计与优化


软件简介抗体药物设计与优化小分子药物发现与优化


近年来以抗体和其他生物治疗方式(如双特异性抗体)为中心的研发项目大幅增加,然而高免疫原性和低溶解度是影响抗体药物开发和疗效的重要因素。Discovery Studio 从抗体序列出发,提供了一套丰富的工具来帮助指导抗体药物设计、模拟优化候选分子,显著加快抗体药物研发速度和降低研发成本。


抗体序列注释与性质预测

抗体结构预测

抗体功能优化

抗体成药性预测与优化

CDR 区的识别、Germlinegene序列识别、翻译后修饰位点预测和抗原线性表位预测

抗体 3D 结构预测、评价与优化

抗体人源化、抗体 - 抗原相互作用预测和抗体亲和力成熟

抗体聚集效应预测与优化、可开发性打分(DI值)、溶解度和粘度预测与评估

1918c3bbff42133cb48dff5402443361.png5a1d9f0728a4db49c378c7ca917baceb.png5707e7db1c64b6d49ef898ecbf50a9c6.pngbecb905997d3b3ede09a7dec08a0ac26.png




经典案例

计算模拟提高全人源抗TSLP抗体的亲和力

关键词:同源模建、抗体- 抗原对接、虚拟氨基酸突变分子动力学模拟

内容摘要:胸腺基质巴细胞生成素(TSLP)是治疗和恶性肿瘤的潜在重要靶点。然而,目前尚无TSLP 的抗体供临床使用。在本研究中,针对已知的人类抗 TSLP 单链抗体可变片段(anti-TSLP-SCF-84),通过计算模拟与实验验证的方式增加其与抗原的亲和力首先利用同源模建的方法分别构建抗体与抗原的3D 结构,随后利用大分子对接ZDock 进行抗体-抗原对接并对对接结果进行虚拟氨基酸突变,预测出潜在提高抗体亲和力的氨基酸突变,最后通过体外表达和纯化蛋白,进行活性验证,发现单点突变的抗体 M4,其亲和力比突变前抗体提高约10倍

380ddaaaaa8df4b153854c8f61afcab6.png

研究流程

1405584e8cbebc8acedb753c3f772340.png

抗体-抗原对接与虚拟氨基酸突变结果