网络药理学相关技术基金项目申请方案

点击数:17932011-06-19 14:17:48 来源: 源资科技官网

网络药理学相关技术基金项目申请方案

 
    随着生物科技和信息技术的创新发展,人们对生命活动的分子机制研究逐步深入,研究焦点已从单个分子转向分子间相互关系及其所构成的复杂网络上(包括代谢网络、基因调控网络和信号转导网络等)。
    当代医学研究发现,肿瘤、糖尿病、心血管疾病等疾病是由多个遗传与非遗传因素共同引发。因此单靶点药物难以有效地治疗这类多因素复杂性疾病。新近兴起的网络生物学及网络药理学是生命科学领域在研究方法学上的一次重大突破,为多靶点药物发现和创制开辟了新路。
    从广义上讲,网络生物学和网络药理学的基本思想都是用复杂网络模型描述研究对象的生物学或药理学性质,通过网络模型分析因果关系,从而认识生命活动规律或药物对机体的作用机制等。
    网络生物学研究的一般方法是:在科学假说的基础上,从大量文献、数据和实验数据中抽提多种性质要素(基因、蛋白质、药理性质等);以性质要素为节点,通过计算节点间相互关系,构建性质相互相关联网络模型,从而推演各性质要素间未知的相互联系。以类风湿关节炎研究为例(http://www.tri-ibiotech.com/topic/n227.html),我们已经知道它是一种系统性免疫系统疾病,通过构建动物模型能够用来研究疾病的分子机制。应用Chenomx NMR suite分析得到相关疾病的血清代谢组数据,将已知的免疫相关的marker与代谢数据进行整合,应用GeneGo平台生成与该疾病相关的分子机制。



References


[1] AM Weljie and C Vitols. June 2006. Identifying and Quantifying Metabolites in Blood Serum and Plasma. Chenomx Inc.
[2] C Vitols. 2008. Chenomx NMR Suite (User Guide). Chenomx Inc.
[3] R Rosewell and C Vitols. March 2006. Identifying Metabolites in Biofluids. Chenomx Inc.
[4] AM Weljie, J Newton, FR Jirik, and HJ Vogel. 2008. Evaluating Low-Intensity Unknown Signals in Quantitative Proton NMR Mixture Analysis. Anal Chem. 80(23):8956-8965
[5] R Kekuda, P Saha, and U Sundaram. 2008. Role of Sp1 and HNF1 transcription factors in SGLT1 regulation during chronic intestinal inflammation. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 294(6):G1354-61

    网络生物学和网络药理学的发展也为药物靶点设计提供了新思路。从一个化合物出发,首先可以预测其代谢产物,然后用QSAR模型预测其ADME/Tox性质。接着,可以在受到该化合物及其代谢物干扰的通路、细胞过程、毒性以及疾病网络中识别、观察到有潜力的靶点。以这样的方法进行研究,科学家们发现了杀虫剂mebendazole的潜在抗肿瘤活性,通过GeneGo Maps Pathway分析阐述了甲苯咪唑通过作用于XIAP调控了细胞凋亡的过程及细胞中Bcl-2磷酸化作用,从而揭示了mebendazole可能的抗肿瘤作用机制。(http://www.tri-ibiotech.com/topic/n222.html

 

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