TRIPOS正式发布MUSE2.1

点击数：4362011-11-21 15:44:28　来源: 源资科技官网

TRIPOS正式发布MUSE2.1
——药物先导优化与全新设计解决方案全面升级

    MUSE是专为加快先导候选药物识别与优化而设计的一个全新药物设计工作流。利用MUSE，CADD科研工作者以及药物化学工作者可以进行满足特定设计指标的全新结构、骨架、或侧链的识别，进行先导化合物的替换、骨架跃迁或在固定母核周围产生新的R-基团，生成满足多重设计指标的新颖类药化合物；并能与公司内部或第三方打分方法整合用作为设计指标；除此之外MUSE还包含一个类药性数据库和一个无效结构数据库，在最大程度上保证了设计结果的有效性。
    目前，Tripos公司发布了MUSE新版本2.1，在2.0版本的基础上又增加了一些新的功能，完全支持Windows7系统，并兼容最新版的KNIME软件。

MUSE2.1的新功能有：

◆  支持Windows7、XP(32位或64位)、32位或64位的RHEL-5
◆  Tripos Score支持最新版的KNIME软件
◆  增加Surflex-dock打分函数
◆  增加各种制图功能

图1、 在Scoring Function的选项中新增了Docking Score打分函数

图2、新增蛋白质和小分子配体输入框，在选定打分函数后，可以直接导入我们的靶标蛋白和相应的配体

图3、 选定“种子结构”，这一步与2.0相似，可以导入或者直接画出Seed Structure

图4、保留核心基团的设定，同上我们也可以画出或者导入Preserved Cores

图5、参数设定，这里可以调整生成结构的数目等参数

图6、这一步可以排除那些在化学功能上没有意义的基团和一些不合理的结构，保证设计结构的准确性
最后，点击“Invent”开始运算。

图7、Muse2.1的运算结果，中间部分为设计得到的配体小分子列表，右侧为配体和蛋白质活性位点的相互作用图

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