首届全国分子模拟与量子化学软件SYBYL & Gaussian联合培训班
点击数:12042011-09-27 10:04:06 来源: 源资科技官网
首届全国分子模拟与量子化学软件SYBYL & Gaussian联合培训班
2011年11月4日-6日 吉林大学理论化学计算国家重点实验室
Gaussian软件是由John Pople主持编写并发布的电子结构计算软件包。经过对不同时期发展起来的各种计算方法的兼收并蓄,Gaussian已经成为一款以量子化学从头算和密度泛函理论计算为主,多种计算方法和计算方式兼备的通用软件,能向科学家提供种类最多、最准确可靠和最受业界认可的计算结果,是用户最多的行业标准软件,并且由于它的全面性,简单性和易用性,几十年来一直受到广大用户和爱好者的认可。目前最新版本是Gaussian09 (Revision B.01)。
美国Tripos公司始终致力于为广大科研用户提供分子模拟和药物设计的全面解决方案,其旗舰产品SYBYL一直是全球最先进的分子模拟和药物设计研发工具,持续的产品更新功能增强,使产品适用于药物研发的各个阶段,并逐渐渗入到生命科学,环境科学,化学化工等领域。目前最新版本为SYBYL X 1.3。
应国内Gaussian和SYBYL新老用户对量子化学和分子模拟软件学习与交流地强烈要求,源资科技联合吉林大学理论化学计算国家重点实验室共同举办“首届全国分子模拟与量子化学软件SYBYL & Gaussian联合培训班”。欢迎广大新老用户踊跃报名!
◆ 课程目标
本届培训班的目标是使学员能够独立完成以下学习内容:
● 3D-QSAR与虚拟筛选新技术:Topomer CoMFA & Topomer Search Topomer CoMFA是一个能够自动生成3D-QSAR模型并且可以预测化合物生物活性或性质的工具。Topomer CoMFA模型可以在几分钟内完成而不是几天,不管是QSAR 的专家还是QSAR的新手都能够很容易地进行操作,并且结果都可以与传统的CoMFA分析进行比较。
Topomer Search是一个特殊快速的基于3D配体的虚拟筛选工具,已被证明为可高效地应用于先导优化和骨架跃迁。Topomer Search在单个进程上一昼夜就可以筛选数百万个结构,这就允许你可以筛选非常大的化合物数据库并且能够避免遗漏重要先导化合物的风险。此外,它还采用构象的独立topomer相似性进行完整分子、侧链或骨架的筛选。
● 分子对接技术:Surflex-Dock Surflex-Dock 是一个蛋白与配体的对接程序,在计算机筛选应用领域跟其它方法相比更快、更精确,从非作用配体中识别出真实作用配体的能力要高出5~10倍。该对接搜索引擎已成为专利技术。
Surflex-Dock集速度、准确度和可用性于一身,采用一个随着阴性训练集化合物的增加而不断升级、参数化的经验打分函数和一个依赖基于表面的分子相似性方法的搜索引擎,其高通量虚拟筛选的阳性富集率是独一无二的。
● 高斯原理讲解及各种计算法介绍
1、Gaussian讲解;
2、Gaussian输入输出文件的编写;
3、GaussView 5.0介绍;
4、Gaussian功能及GaussView输入文件的编写:
A. 模型化学方法;(1) 分子力学方法;(2) 半经验方法;(3) 自洽场方法;(4) 密度泛函方法;(5) 电子相关方法;(6) 组合式高精度能量计算;(7) 基组
B.几何构型优化、频率分析和波函数优化
C.分子性质
D.ONIOM分层计算
E.激发态计算
F.溶剂模型
● Gaussian09常用新功能介绍:
A. 从片段的初始猜测产生整个分子的初始猜测;
B. 新增半经验方法简介
C. 新增密度泛函方法简介
D. 双杂化密度泛函B2PLYP和MPW2PLYP
E. 输入amplitudes(CC, CCD, CCSD, CCSD(T), BD, BD(T)相关方法)
F. 用于纯泛函计算的基组
G. TD-DFT
H. EOM-CCSD
I. 断点续算
J. 效率改进
K. 默认设置变化
◆ 日程安排
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日期 |
时间 |
培训内容 |
主讲人 |
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11月4日 |
8:30-9:00 |
登记注册 |
Tripos中国区高级技术支持:范峰 博士 |
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9:00-12:00 |
第二代QSAR技术 |
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13:30-17:00 |
分子对接技术 |
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11月5日 |
8:30-12:00 |
高斯基础原理的讲解 |
GAUSSIAN 中国区高级技术支持 吴博士 |
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13:30-17:00 |
高斯各种算法的讲解 |
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11月6日 |
8:30-11:30 |
Gaussian09常用新功能讲解 |
GAUSSIAN 中国区高级技术支持 吴博士 |
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13:30-17:00 |
◆ 培训地点
吉林省长春市柳条路2号 吉林大学前卫北区科技楼
◆ 如何报名
如果您计划参加,请填好回执发到如下的EMAIL地址或通过电话与我们联系:
电话:010-62521016,13910121407
联系人:李嘉轩 先生
邮箱:marketing@tri-ibiotech.com.cn 网址:www.tri-ibiotech.com
◆ 价格及相关事项
为达到最佳培训效果,采取小班授课的方式,限额30人。主办方提供硬件设备与场地。
注:食宿自理,请尽量自带笔记本电脑。
收费标准:2000元/人,企业用户享受8折优惠,学术用户享受6折优惠。请于2011年10月20日之前完成汇款。
户名:源资信息科技(上海)有限公司
账号:1001242709300376015
开户行:工行虹桥开发区支行
◆ 推荐住宿
如家快捷酒店(长春********二店)