软件资料:
软件名称:MetaDrug
软件类别:GeneGo
录入时间:2011-02-21 16:25:42


软件简介:
MetaDrug™是一个系统药理学和毒理学平台,用来预测小分子新化合物可能的适应症、非靶效应以及潜在的毒性靶标。


详细介绍:

 

MeatDrugTM的应用:

    化合物对比,药物靶点的预测,基于结构的药物ADME/Tox与安全性药理分析,药物化学与先导物的优先性评价,以药理与安全性评价为目的的基因组学、蛋白质组学数据分析,HCS与HTS数据分析,生物标记物识别,代谢物预测。

 

关于MetaDrug™:

    MetaDrug™是一个系统药理学和毒理学平台,用来预测小分子新化合物可能的适应症、非靶效应以及潜在的毒性靶标。MetaDrug™以独特的方式从结构与实验数据的角度预测人的代谢作用、毒性和化合物作用方式。用MetaDrug™,研究人员多个起点出发着手分析,使得在药物开发的整个流程中获得最大程度地灵活性与实用性。

 

    从一个化合物结构出发,首先可以预测其代谢产物,然后用QSAR模型预测其ADME/Tox性质。接着,可以在受到该化合物及其代谢物干扰的通路、细胞过程、毒性以及疾病网络中识别、观察到有潜力的靶点。

 

    当得到经验数据的时候,比如基因组学、蛋白质组学、代谢组学以及药理基因组学数据,可以通过一个通用的分析程序将这些数据导入到MetaDrug™,然后逐个分析或与结构信息学横向相结合进行分析。MetaDrug™的分析工具箱可以访问一个专利独有、专家手工加工的数据库。该数据库包含有配体-受体相互作用、外源性和内源性代谢物、细胞信号等资料。MetaDrug™可以作为一个独立的平台使用,还可以与MetaCoreTM联合使用。

 

关键性能:

基于规则的方法预测人的代谢物  

预测ADME-Tox性质,并可搭建自己的QSAR模型 

以适应症、ADME参数以及毒性为基础对化合物的开发进行优先性排序 

强大的组学数据分析能力,用于生物学、毒理学以及疾病分类 绝大部分的常用分析自动流程化 

组学类数据可视化,谱图及网络的质量达到发表论文的目的 

化合物、代谢物合并到信号通路、代谢通路与网络的视图 

对蛋白类数据库添加了关于配体-受体、信号相互作用的信息 

可以搜寻药物、药物靶点、生物活性化合物、子结构(药效团、毒效团),通过现有药物结构相似性搜寻以预测新化合物的潜在生物活性 

 

实验数据:

    可以将诸如基因组学、蛋白质组学、代谢组学与HTS/TCS之类的数据导入到MetaDrugTM。本系统的一个特点是:可以将化学的、生物学的等多种类型的数据在通路与网络上一并体现。可以接受的数据类型包括:

MOL, SD 以及CDX格式的结构文件

通过CAS登记号、SMILES或Brutto分子式导入NMR或MS代谢数据

基因表达数据: whole genome arrays, focused arrays, QPCR and SAGE

蛋白质组数据

siRNA array

HTS与HCS数据 

MetaDrugTM值的关注的内容:

含有大约几十万药物、先导化合物、外源物质与内原物质代谢物的数据库

683张权威的通路谱图,描述了关键的生物学过程以及药理与毒理作用模式

400张网络描述了与毒理作用相关的药物干扰过程

疾病专用的网络

蛋白-蛋白与蛋白-DNA信号相互作用

从科技文献与专利文献加工收集而得的配体-受体相互作用

外源性的与内源性的物质代谢反应

 

硬件要求:

客户端(通过网络以及内部安装使用):

P4 CPU 以及1GB内存

Internet Explorer 6.0或更高版本

Macromedia Flash Player 8或更高版本

ChemDraw ActiveX / Plugin Net 9.0下载版

服务器端(内部安装使用):

2个或更多个3.2GHz或更高级别的P4/XEON CPU,4GB的内存

至少36GB的SCSI硬盘

操作系统:安装了X development package的RedHat Enterprise Linux 3, 4;SuSE 9.2;CentOS 4.4

Oracle 9.2或10.2 DBMS以及客户端工具

X86-64bit目前也可以用。

 

MetaDrug™灵活的商务模式:

通过网络端口访问或内部安装使用

每年一次或几年一次授权方式

指定账号用户或并发用户授权 

 

关于GeneGo:

    GeneGo是系统生物学、系统毒理学以及通路分析领域的领跑者。 我们的工具和数据库有助于捕捉隐藏在高内含实验数据背后的生命现象,并有助于理解生物活性小分子在人组织中以及模型物种中的作用。我们为基础生命科学研究 以及药物开发中的各种应用提供方案,从临床前发现与新药申请到临床研究,覆盖了生物学与化学的各个方面。



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