软件资料:
软件名称:EA-Inventor & RACHEL
软件类别:SYBYL-X
录入时间:2010-07-19 15:31:23


软件简介:
从头药物设计引擎;RACHEL:先导化合物的高级优化工具 全新药物设计 De Novo Design


详细介绍:

EA-Inventor:从头药物设计引擎

EA-Inventor是一种全新的从头药物设计方法,它采用进化算法,使研究人员能够发现新的化合物(先导物发现),固定骨架上新的R取代基(先导物探测),或者新的骨架(先导物或骨架搭建)。与传统的全新药物设计程序相比,EA-Inventor能使用户对新结构的产生和评价有所控制,这对计算机辅助先导物的发现、先导物探测和先导物或骨架搭建是非常重要的。

 

RACHEL:先导化合物的高级优化工具

先导物的优化是一门艺术,许多理论上认为会提高亲和力的结构修饰方式往往适得其反,它是一项耗时费力的工作。RACHEL就是专门针对这一艰苦任务设计的先导化合物优化工具。

从配体-受体复合物结构出发,RACHEL通过系统化修改配体上用户定义位点对先导化合物进行自动的组合优化。这些化合物是在活性位点处进行构象搜索以及评价,只有那些和受体结合紧密的化合物才会被保留下来。这个新的化合物经处理产生了下一代衍生物,如此循环,该先导化合物被最终优化为一组具有高亲和力的化合物集。

 

图为利用RACHEL模块产生的与野生型燕鸥N9流感病毒唾液酸苷酶(2QWK)结合的5个活性配体分子



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